Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms