Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trappc6aQ78XR0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trappc6aQ78XR0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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