Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspg5Q71M36 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms