Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms