Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssxb3Q6XAS4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssxb3Q6XAS4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssxb3Q6XAS4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssxb3Q6XAS4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssxb3Q6XAS4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssxb3Q6XAS4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssxb3Q6XAS4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ssxb3Q6XAS4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ssxb3Q6XAS4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ssxb3Q6XAS4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ssxb3Q6XAS4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ssxb3Q6XAS4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ssxb3Q6XAS4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ssxb3Q6XAS4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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