Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms