Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms