Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Timd4Q6U7R4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Timd4Q6U7R4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Timd4Q6U7R4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Timd4Q6U7R4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Timd4Q6U7R4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Timd4Q6U7R4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Timd4Q6U7R4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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