Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms