Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PdgfrlQ6PE55 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PdgfrlQ6PE55 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms