Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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