Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms