Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
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Zbtb40Q6PCS8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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