Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms