Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms