Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms