Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms