Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cep78Q6IRU7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms