Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms