Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms