Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Lrrcc1Q69ZB0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrcc1Q69ZB0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Lrrcc1Q69ZB0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Lrrcc1Q69ZB0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Lrrcc1Q69ZB0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Lrrcc1Q69ZB0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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