Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9aQ68FE2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9aQ68FE2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9aQ68FE2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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