Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms