Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sf1Q64213 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sf1Q64213 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sf1Q64213 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms