Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Znf260Q62513 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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