Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms