Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Hoxa13Q62424 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Hoxa13Q62424 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Hoxa13Q62424 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Hoxa13Q62424 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Hoxa13Q62424 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Hoxa13Q62424 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa13Q62424 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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