Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ttf1Q62187 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ttf1Q62187 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ttf1Q62187 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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