Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms