Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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