Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms