Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms