Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms