Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc6a4Q60857 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc6a4Q60857 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc6a4Q60857 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc6a4Q60857 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc6a4Q60857 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc6a4Q60857 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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