Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms