Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms