Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SkiQ60698 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SkiQ60698 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SkiQ60698 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 543.5 ms