Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms