Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec4a4Q5YIR8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clec4a4Q5YIR8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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