Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms