Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms