Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd40Q5SUE8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 337.6 ms