Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms