Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms