Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Trim58Q5NCC9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Trim58Q5NCC9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Trim58Q5NCC9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Trim58Q5NCC9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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