Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8B9

Frem3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem3Q5H8B9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Frem3Q5H8B9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms