Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms