Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1td1Q587J6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms