Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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