Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms